Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SREBF2Q12772 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
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