Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms