Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms