Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPFP49454 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPFP49454 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPFP49454 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPFP49454 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPFP49454 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPFP49454 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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CENPFP49454 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPFP49454 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPFP49454 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPFP49454 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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CENPFP49454 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPFP49454 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPFP49454 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPFP49454 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPFP49454 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPFP49454 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPFP49454 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPFP49454 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPFP49454 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPFP49454 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPFP49454 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPFP49454 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPFP49454 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPFP49454 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPFP49454 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPFP49454 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPFP49454 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPFP49454 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPFP49454 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPFP49454 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPFP49454 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPFP49454 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPFP49454 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPFP49454 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPFP49454 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPFP49454 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPFP49454 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPFP49454 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPFP49454 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPFP49454 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPFP49454 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPFP49454 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPFP49454 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPFP49454 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPFP49454 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPFP49454 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPFP49454 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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