Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 ARFGEF1-201ENST00000262215 7225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT3P45378 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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