Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF208O43345 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms