Protein–RNA interactions for Protein: V9GY48

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY48 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
V9GY48 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
V9GY48 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
V9GY48 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
V9GY48 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
V9GY48 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
V9GY48 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
V9GY48 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
V9GY48 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
V9GY48 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
V9GY48 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
V9GY48 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
V9GY48 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
V9GY48 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
V9GY48 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
V9GY48 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
V9GY48 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
V9GY48 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
V9GY48 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
V9GY48 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
V9GY48 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
V9GY48 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
V9GY48 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
V9GY48 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
V9GY48 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
V9GY48 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
V9GY48 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
V9GY48 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
V9GY48 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
V9GY48 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
V9GY48 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
V9GY48 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
V9GY48 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
V9GY48 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
V9GY48 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
V9GY48 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
V9GY48 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
V9GY48 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
V9GY48 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
V9GY48 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
V9GY48 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
V9GY48 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
V9GY48 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
V9GY48 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
V9GY48 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
V9GY48 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
V9GY48 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
V9GY48 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
V9GY48 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
V9GY48 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
V9GY48 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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