Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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ZNF346Q9UL40 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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ZNF346Q9UL40 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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ZNF346Q9UL40 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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ZNF346Q9UL40 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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ZNF346Q9UL40 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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ZNF346Q9UL40 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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ZNF346Q9UL40 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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ZNF346Q9UL40 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF346Q9UL40 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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