Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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