Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 Metazoa_SRP.12-201ENST00000553249 268 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 IFNA1-201ENST00000276927 863 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms