Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms