Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms