Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms