Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms