Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 OR2A1-AS1-203ENST00000468575 568 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 SUMO1-202ENST00000392245 1071 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 CACNA1C-IT3-201ENST00000542680 622 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AC079325.1-201ENST00000430386 857 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms