Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TAF13Q15543 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TAF13Q15543 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TAF13Q15543 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TAF13Q15543 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TAF13Q15543 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TAF13Q15543 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TAF13Q15543 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TAF13Q15543 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms