Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
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