Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms