Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR5A1Q13285 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR5A1Q13285 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms