Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 AC026797.1-201ENST00000624837 2869 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 VAV1-207ENST00000599806 2717 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 STRA6-204ENST00000423167 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 DHX30-206ENST00000446256 3660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 AL139011.2-201ENST00000556710 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 CHGB-201ENST00000378961 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 LPP-AS2-201ENST00000605573 2852 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 TMEM199-201ENST00000292114 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 G2E3-202ENST00000438909 2334 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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