Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC173Q0VFZ6 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms