Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms