Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CACNA1DQ01668 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms