Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ME1P48163 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ME1P48163 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms