Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPOP42166 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPOP42166 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPOP42166 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPOP42166 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPOP42166 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPOP42166 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPOP42166 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPOP42166 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPOP42166 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPOP42166 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPOP42166 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPOP42166 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPOP42166 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPOP42166 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPOP42166 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPOP42166 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPOP42166 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPOP42166 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPOP42166 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPOP42166 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPOP42166 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPOP42166 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPOP42166 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPOP42166 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPOP42166 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPOP42166 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPOP42166 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPOP42166 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPOP42166 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPOP42166 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPOP42166 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPOP42166 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPOP42166 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPOP42166 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPOP42166 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPOP42166 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPOP42166 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMPOP42166 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMPOP42166 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMPOP42166 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMPOP42166 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMPOP42166 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPOP42166 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPOP42166 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPOP42166 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPOP42166 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPOP42166 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPOP42166 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPOP42166 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPOP42166 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPOP42166 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPOP42166 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPOP42166 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPOP42166 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPOP42166 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPOP42166 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPOP42166 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPOP42166 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPOP42166 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPOP42166 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPOP42166 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPOP42166 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPOP42166 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPOP42166 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPOP42166 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPOP42166 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPOP42166 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPOP42166 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPOP42166 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPOP42166 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPOP42166 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPOP42166 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPOP42166 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPOP42166 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPOP42166 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPOP42166 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPOP42166 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPOP42166 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPOP42166 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPOP42166 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPOP42166 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPOP42166 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMPOP42166 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMPOP42166 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TMPOP42166 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMPOP42166 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TMPOP42166 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMPOP42166 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMPOP42166 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMPOP42166 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMPOP42166 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMPOP42166 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMPOP42166 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TMPOP42166 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMPOP42166 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMPOP42166 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMPOP42166 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMPOP42166 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TMPOP42166 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.4 ms