Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms