Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms