Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
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PTPRBP23467 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
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PTPRBP23467 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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PTPRBP23467 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PTPRBP23467 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PTPRBP23467 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PTPRBP23467 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PTPRBP23467 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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PTPRBP23467 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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