Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms