Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms