Protein–RNA interactions for Protein: G5E9R7

KRTAP4-16, HCG2042993, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-16G5E9R7 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-16G5E9R7 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms