Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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