Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HELTA6NFD8 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms