Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms