Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 RNF24-201ENST00000336095 7453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 PLEKHM1P1-202ENST00000578036 4318 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 CEP41-201ENST00000223208 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms