Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms