Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NRF1Q16656 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms