Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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