Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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KCNH2Q12809 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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KCNH2Q12809 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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KCNH2Q12809 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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KCNH2Q12809 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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KCNH2Q12809 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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KCNH2Q12809 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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KCNH2Q12809 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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