Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms