Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT1P21579 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT1P21579 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT1P21579 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT1P21579 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT1P21579 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT1P21579 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT1P21579 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT1P21579 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT1P21579 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT1P21579 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT1P21579 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT1P21579 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT1P21579 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT1P21579 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT1P21579 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT1P21579 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT1P21579 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYT1P21579 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYT1P21579 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYT1P21579 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYT1P21579 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYT1P21579 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYT1P21579 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYT1P21579 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYT1P21579 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYT1P21579 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYT1P21579 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYT1P21579 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYT1P21579 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYT1P21579 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYT1P21579 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYT1P21579 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT1P21579 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT1P21579 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT1P21579 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT1P21579 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT1P21579 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT1P21579 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT1P21579 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT1P21579 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT1P21579 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT1P21579 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT1P21579 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT1P21579 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT1P21579 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT1P21579 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT1P21579 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT1P21579 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT1P21579 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT1P21579 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT1P21579 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT1P21579 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT1P21579 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT1P21579 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT1P21579 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT1P21579 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT1P21579 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT1P21579 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT1P21579 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT1P21579 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT1P21579 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT1P21579 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT1P21579 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT1P21579 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT1P21579 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT1P21579 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT1P21579 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT1P21579 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms