Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NELFEP18615 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NELFEP18615 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NELFEP18615 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NELFEP18615 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NELFEP18615 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NELFEP18615 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NELFEP18615 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NELFEP18615 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NELFEP18615 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NELFEP18615 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NELFEP18615 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NELFEP18615 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NELFEP18615 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NELFEP18615 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NELFEP18615 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NELFEP18615 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NELFEP18615 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NELFEP18615 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NELFEP18615 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NELFEP18615 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
NELFEP18615 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
NELFEP18615 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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