Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F6O75461 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F6O75461 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F6O75461 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F6O75461 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F6O75461 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F6O75461 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F6O75461 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F6O75461 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F6O75461 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F6O75461 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F6O75461 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F6O75461 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F6O75461 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F6O75461 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F6O75461 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F6O75461 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F6O75461 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F6O75461 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F6O75461 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F6O75461 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F6O75461 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F6O75461 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F6O75461 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F6O75461 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F6O75461 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F6O75461 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F6O75461 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F6O75461 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F6O75461 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F6O75461 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F6O75461 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F6O75461 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F6O75461 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F6O75461 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F6O75461 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F6O75461 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F6O75461 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F6O75461 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F6O75461 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms