Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
A4D1N5 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
A4D1N5 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
A4D1N5 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
A4D1N5 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
A4D1N5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
A4D1N5 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
A4D1N5 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
A4D1N5 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
A4D1N5 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
A4D1N5 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
A4D1N5 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
A4D1N5 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
A4D1N5 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
A4D1N5 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
A4D1N5 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
A4D1N5 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
A4D1N5 TUSC5-201ENST00000333813 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
A4D1N5 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
A4D1N5 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
A4D1N5 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
A4D1N5 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
A4D1N5 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 FAM106A-201ENST00000392176 2281 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 NCAM1-202ENST00000401611 2510 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 ANGPTL7-201ENST00000376819 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A4D1N5 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms