Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A4

CFAP20, Cilia- and flagella-associated protein 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP20Q9Y6A4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms