Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4G8

RAPGEF2, Rap guanine nucleotide exchange factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF2Q9Y4G8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
RAPGEF2Q9Y4G8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
RAPGEF2Q9Y4G8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
RAPGEF2Q9Y4G8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
RAPGEF2Q9Y4G8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
RAPGEF2Q9Y4G8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
RAPGEF2Q9Y4G8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
RAPGEF2Q9Y4G8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
RAPGEF2Q9Y4G8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
RAPGEF2Q9Y4G8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
RAPGEF2Q9Y4G8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
RAPGEF2Q9Y4G8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
RAPGEF2Q9Y4G8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
RAPGEF2Q9Y4G8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
RAPGEF2Q9Y4G8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
RAPGEF2Q9Y4G8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms