Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y478

PRKAB1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB1Q9Y478 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms