Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1DQ9Y2S0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms