Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms