Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK5

VANGL2, Vang-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VANGL2Q9ULK5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VANGL2Q9ULK5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VANGL2Q9ULK5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms